微笑列車項目自1999年3月由中華慈善總會組織承辦以來，通過與各參與方的密切合作，不斷完善項目管理方式，廣泛開展項目宣傳活動，為貧困患者補貼交通食宿費用，為部分合作醫院補貼手術款等，救治地域不斷擴大，救治人員不斷增多，得到了社會各界的廣泛贊譽和認可。

2007年起，微笑列車項目邁向了一個新的發展階段。國家衛生部和中華口腔醫學會接受美國微笑列車基金會的邀請，成為正式的項目合作伙伴。同時，大規模增加了手術合作醫院，對項目的組織管理結構進行了調整，對各合作方的職責進一步明確。使微笑列車項目既有來自政府的行政支持，又有來自專業學會的技術指導，還有來自全國慈善會的傾力合作，成為一個集政府機構、醫療單位、慈善團體多部門大協作的最具規模的全國性慈善項目。

該項目自1999年開展以來，通過各參與方的共同努力，取得了令世人矚目的成績。完成38萬例免費手術。有效地提高了我國貧困唇腭裂患者的生活質量。